Από τα σημαντικότερα εκθέματα του Μουσείου είναι το μετάλλιο του νικητή στον πρώτο Ολυμπιακό Μαραθώνιο της Αθήνας το 1896, Σπύρου Λούη. Το δίπλωμά για την συμμετοχή του στον αγώνα, το καπέλο “φεσάκι” της παραδοσιακής Ελληνικής στολής που φορούσε πάντα. Αντίγραφο του κυπέλου που του απονεμήθηκε και είχε αθλοθετήσει ο Μισέλ Μπρεάλ. Φωτογραφίες εποχής.
Αθλητικά και προσωπικά κειμήλια του 2ου στην Ιστορία Ολυμπιονίκη του Μαραθωνίου της Αθήνας το 1896, κοσμούν το Μουσείο Μαραθωνίου Δρόμου. Τα εκθέματα αποτελούν δωρεά της οικογένειας του ένδοξου Μαραθωνοδρόμου.
To μετάλλιο του νικητή της Βοστόνης το 1946 Στέλιου Κυριακίδη κοσμεί το Μουσείο Μαραθωνίου Δρόμου. Μια μοναδική συλλογή από την αθλητική και κοινωνική δράση του ένδοξου Μαραθωνοδρόμου Στέλιου Κυριακίδη αποτελούμενη από μετάλλια, ‘έπαθλα , διπλώματα, κύπελλα κ.α Τα εκθέματα αποτελούν δωρεά του υιού του Δημήτρη Κυριακίδη.
Στο Μουσείο Μαραθωνίου Δρόμου εκτίθενται τα κειμήλια από την ζωή και την δράση του Βουλευτή, Βαλκανιονίκη και ειρηνιστή Γρηγόρη Λαμπράκη με σημαντικότερο την σημαία με το έμβλημα της ειρήνης από την Πορεία του 1963. Τα εκθέματα αποτελούν δωρεά της οικογένειας.
